کتابخانه در راستای تضمین ایمنی مراجعین، مطابق با پروتکل‌های ایمنی بیمارستان، برنامه‌ریزی‌های لازم را برای مواجهه با حوادث غیرمترقبه (مانند زلزله و آتش‌سوزی) دنبال می‌کند. وجود تجهیزات اولیه اطفاء حریق، برگزاری مانورهای دوره‌ای، و آموزش کارکنان برای واکنش صحیح در شرایط بحرانی و همچنین نگهداری و به‌روزرسانی تجهیزات ایمنی مطابق با استانداردهای ملی و بین‌المللی، تمامی این تمهیدات در سطحی مطلوب پیاده‌سازی و به‌روزرسانی می‌شوند. همچنین جهت ارتقای سطح ایمنی سازه‌ای و انطباق کامل با استانداردهای نوین لرزه‌خیز، مکاتبات مستمر و مکاتبات فنی با واحدهای مربوطه در دانشگاه علوم پزشکی جهت بررسی و به‌روزرسانی زیرساخت‌های فیزیکی در جریان است تا انطباق کامل با آخرین استانداردهای مهندسی ساختمان در حوادث طبیعی حاصل گردد.